Le syndicat intercommunal d'aménagement de la Dheune a décidé de réaliser l'aménagement du moulin de Cissey, sur la commune de Merceuil, dans le cadre des travaux prévus pour favoriser l'écoulement dans les bras secondaires afin de soulager la Dheune en temps de crue. Ces travaux ont, d'ores et déjà, permis de protéger les communes de Merceuil et de Demigny.
Des travaux sont nécessaires pour faire face aux débits que doit supporter le moulin de Cissey. Un bras de décharge sera créé, géré par un clapet semi-automatique qui permettrait de faire passer le surplus de débit vers le bras principal de la Dheune. Le coût prévisionnel HT des travaux est évalué à 920 000 francs. Le financement est assuré par les départements de la Côte-d'Or et de Saône-et-Loire, et le Syndicat de la Dheune.