Jean-Philippe Trin intègre le groupe Bouygues en 1987 : il y exerce des responsabilités travaux chez DTP, puis il rejoint VSL en 1994 en tant que directeur général de VSL à Hong Kong. Trois ans plus tard, il devient directeur général adjoint de VSL, en charge de toute l'Asie, de l'Europe centrale et du Moyen Orient. En janvier 2000, il est nommé directeur général de VSL et d'Intrafor en 2001 puis Président-directeur général de VSL et de DTP Terrassement en 2004.
En novembre 2009, il est nommé Président-directeur général de Bouygues Energies & Services, puis, en mars 2015, directeur général délégué de Bouygues Construction, en charge de Bouygues Travaux Publics, DTP et VSL. Jean-Philippe Trin est promu directeur général délégué en charge du pôle Travaux Publics ainsi que de la politique matériel en mars 2018.